164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4303 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  279  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  95 
 
 
140 aa  266  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0169  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  47.93 
 
 
149 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  47.93 
 
 
149 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  45.95 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  39.04 
 
 
150 aa  77  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4029  hypothetical protein  43.43 
 
 
102 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.64412 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4178  putative transposase, ISRm14  42 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  36.36 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  36.36 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  36.36 
 
 
133 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  37.14 
 
 
140 aa  66.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  40.54 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  35.42 
 
 
123 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  51.72 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  51.72 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  51.72 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  51.72 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  51.72 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  51.72 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  54.24 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  44.29 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
121 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  48.28 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  44.59 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  38.27 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4875  transposase IS3/IS911 family protein  47.27 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64301  normal  0.539748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  49.12 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  50 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  49.09 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  32.82 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  46.55 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  46.55 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3206  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  45.33 
 
 
554 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.662551  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  49.09 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  49.09 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 
156 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 
156 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  29.51 
 
 
115 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  42.25 
 
 
154 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  48.39 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  48.39 
 
 
133 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
133 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  30.83 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 
129 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  33.09 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1965  transposase IS3/IS911  43.33 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  29.1 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  44.83 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  43.75 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  43.75 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  49.12 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>