175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0935 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
149 aa  288  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  288  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  78.68 
 
 
136 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4029  hypothetical protein  97.03 
 
 
102 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.64412 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4178  putative transposase, ISRm14  91.09 
 
 
102 aa  175  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  54.11 
 
 
150 aa  136  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  47.54 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  47.54 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  47.54 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  47.54 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  47.54 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  47.54 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  47.54 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  47.54 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  47.54 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  47.54 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  47.54 
 
 
140 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  44.29 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  46.55 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  42.5 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4875  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64301  normal  0.539748 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3206  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  81.25 
 
 
554 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.662551  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  39.85 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  44.55 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  44.57 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  40.3 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  40.3 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  40.3 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  46.91 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  35.04 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 
176 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  32.76 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  32.76 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3309  transposase IS3/IS911 family protein  39.82 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.437547 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  33.61 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  32.76 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  33.82 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  30.36 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  45.68 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  36.79 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  36.79 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  27.91 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  37.8 
 
 
131 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  30.3 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  30.3 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  30.58 
 
 
133 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  30.58 
 
 
129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  30.58 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  35.34 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  41.98 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  34.92 
 
 
139 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  31.43 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  46.38 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  31.71 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2291  hypothetical protein  40.7 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  25.78 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3198  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  31.71 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6122  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  39.71 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  36.36 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  37.5 
 
 
224 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  48.98 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  48.98 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>