63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0779 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0779  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  150  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  51.61 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  50 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  48.33 
 
 
109 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  48.33 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  50.82 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  43.08 
 
 
160 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  66.67 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  66.67 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25470  transposase IS3/IS911  56.25 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  46.81 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  46.81 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  46.81 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  52.27 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  55.32 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  54.35 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  47.83 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  47.83 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  47.83 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  47.83 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  45.65 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  45.65 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  45.65 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  45.65 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  45.65 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  45.65 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1965  transposase IS3/IS911  52.94 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  47.83 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  43.66 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  50 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  50 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  43.66 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  55.26 
 
 
129 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  64.52 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  42 
 
 
135 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  42 
 
 
135 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  42 
 
 
135 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  42 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  52.63 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  42 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  48.72 
 
 
123 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>