223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2406 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  100 
 
 
141 aa  279  9e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  98.51 
 
 
135 aa  259  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  96.27 
 
 
135 aa  256  6e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  95.52 
 
 
135 aa  254  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  95.52 
 
 
135 aa  254  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  62.4 
 
 
125 aa  157  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  56.3 
 
 
121 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  56.3 
 
 
121 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  56.3 
 
 
121 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  56.3 
 
 
121 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  56.3 
 
 
121 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  56.3 
 
 
121 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  55 
 
 
122 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  55 
 
 
122 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  55 
 
 
121 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 
121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  55.46 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  54.17 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  50.41 
 
 
133 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  50.41 
 
 
133 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  50.41 
 
 
133 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  52.59 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  52.03 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  52.03 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  49.57 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  52.99 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  51.72 
 
 
121 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  51.22 
 
 
133 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
133 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
133 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
133 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
133 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  50.41 
 
 
133 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  50.41 
 
 
133 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  44.17 
 
 
154 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  45.59 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2332  ISRSO10-transposase ORFA protein  52.33 
 
 
88 aa  94.4  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2541  transposase IS3/IS911 family protein  53.33 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.901832  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  43.88 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
85 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  42.86 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  42.86 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0716  transposase  53.33 
 
 
61 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  46.43 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
131 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
131 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  46.43 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  42.67 
 
 
168 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  49.06 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  32.35 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  57.41 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  49.06 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  49.06 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  40.3 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  40.35 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  43.08 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  46.43 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  46.43 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  39.06 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4780  transposase IS3/IS911 family protein  42.05 
 
 
128 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248666  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  44.44 
 
 
154 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  38.64 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  36.67 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  49.12 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3972  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 
283 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  49.12 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  49.12 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  49.12 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  49.12 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  49.12 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  49.12 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.734603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>