96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5766 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 158 aa  315  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  75.97 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  49.15 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 		 125 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  44.62 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  44.62 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  45.59 
 
 		 141 aa  97.4  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  45.38 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  43.85 
 
 		 135 aa  95.5  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 		 139 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  41.32 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  41.32 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  41.32 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  41.32 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  41.32 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  41.32 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  43.33 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  43.33 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  43.33 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  42.5 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  43.27 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  43.27 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  40.38 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  39.42 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  39.42 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  39.42 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  39.42 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  39.42 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  39.22 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  39.22 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2332  ISRSO10-transposase ORFA protein  44.71 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  38.46 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  40.26 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  42.67 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2541  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.901832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  49.06 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  33.78 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  29 
 
 		 399 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  34.25 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  26.6 
 
 		 374 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  26.6 
 
 		 374 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  26.6 
 
 		 374 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  26.6 
 
 		 374 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  26.6 
 
 		 374 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 374 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  26.6 
 
 		 374 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2803  transposase IS3/IS911  30.34 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227333  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 128 aa  43.9  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  32.53 
 
 		 492 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  36.84 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  36.84 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  35.94 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0294  transposase IS3/IS911  27.72 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00451426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0389  transposase IS3/IS911  27.72 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.995377  normal  0.39936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0648  transposase IS3/IS911  27.72 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0903  transposase IS3/IS911  27.72 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2063  transposase IS3/IS911  27.72 
 
 		 113 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0960401 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5212  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 139 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2991  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 99 aa  41.2  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  43.14 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1582  hypothetical protein  40.32 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.447037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  32.5 
 
 		 87 aa  40.8  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1684  transposase IS3/IS911  30.67 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>