57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1582 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1582  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  258  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.447037 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  47.33 
 
 
136 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  42.24 
 
 
135 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1804  transposase IS3/IS911 family protein  40.8 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4399  transposase IS3/IS911 family protein  41.96 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134241  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3698  hypothetical protein  41.96 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.451428 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3198  transposase IS3/IS911 family protein  43.9 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  35.43 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4110  hypothetical protein  38.02 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4930  hypothetical protein  54.24 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.527295  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  39.52 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  33.06 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  33.06 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  33.06 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  33.87 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  39.67 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  30 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  30 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  33.33 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  34.82 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  34.82 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  33.33 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  34.82 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  32.08 
 
 
127 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  32.08 
 
 
127 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
131 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  47.92 
 
 
131 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  38.81 
 
 
129 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  51.72 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  51.72 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  29.84 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4610  transposase IS3/IS911 family protein  36.3 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695949  normal  0.162062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  36.36 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  51.72 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  52.73 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4915  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.269908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  52.73 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  44.44 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  38.75 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  38.75 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  44.44 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  38.75 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  44.44 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3972  transposase IS3/IS911 family protein  34.12 
 
 
283 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  44.44 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
121 aa  42  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  33.77 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  43.86 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  37.38 
 
 
113 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  41.18 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  41.18 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  35.79 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>