151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0397 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 119 aa  240  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  55.65 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  43.55 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  43.55 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4915  transposase IS3/IS911 family protein  34.19 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.269908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  42.86 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  45.1 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  45.1 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  45.1 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  34.51 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  48.39 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  37.97 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  47.06 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  47.06 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  40.58 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  41.27 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  29.84 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  29.84 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  29.84 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  39.22 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  39.22 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  39.22 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  39.22 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  39.22 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  39.22 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  36.78 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  36.78 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  36.78 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  42.37 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  42.37 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  42.37 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  42.86 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  41.38 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  45.83 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  27.78 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  36.15 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  41.51 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  41.27 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  32.2 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  37.5 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  37.5 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  30.68 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  35.59 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  39.22 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  35.59 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  39.68 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  39.22 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  29.21 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  39.22 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  45.45 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2335  remnant of ISRSO10-transposase protein  46.51 
 
 		 51 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  35.62 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  43.18 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  25.21 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1965  transposase IS3/IS911  39.62 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  28.1 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  43.18 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  43.18 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  28.32 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  27.66 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  33.82 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  33.82 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  33.82 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  33.82 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  33.82 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  33.82 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  33.82 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  33.82 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>