155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4820 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
168 aa  327  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  99.26 
 
 
135 aa  264  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  38.93 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  38.93 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4915  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.269908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  50.77 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  50.77 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  50.77 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  50.77 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  49.23 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  49.23 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  49.23 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  49.23 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  49.23 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  49.23 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  55.77 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  55.77 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 
127 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  39.53 
 
 
127 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
143 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 
136 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
143 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 
143 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 
133 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  47.69 
 
 
135 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  50 
 
 
68 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  42.67 
 
 
141 aa  57.8  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  44.62 
 
 
121 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  48.21 
 
 
135 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  38.55 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  49.06 
 
 
139 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
129 aa  55.1  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  42.86 
 
 
135 aa  54.7  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  42.86 
 
 
135 aa  54.3  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  42.86 
 
 
135 aa  54.7  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  33.61 
 
 
142 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  44.62 
 
 
154 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  44.23 
 
 
125 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  39.02 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  49.02 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  37.21 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  30.83 
 
 
129 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  32.88 
 
 
131 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4110  hypothetical protein  31.69 
 
 
133 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  51.92 
 
 
133 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  51.92 
 
 
133 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  51.92 
 
 
133 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  51.92 
 
 
133 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  51.92 
 
 
133 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  51.92 
 
 
133 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  51.92 
 
 
133 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  44.9 
 
 
122 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  36.36 
 
 
120 aa  50.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3698  hypothetical protein  32.62 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.451428 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4399  transposase IS3/IS911 family protein  32.62 
 
 
135 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134241  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  35.35 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  35.35 
 
 
123 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1804  transposase IS3/IS911 family protein  31.17 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4959  hypothetical protein  36.04 
 
 
298 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00383302  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  35.34 
 
 
136 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  40.74 
 
 
146 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  47.27 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  47.27 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  38.27 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  47.27 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  43.86 
 
 
129 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  31.51 
 
 
131 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  47.06 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  41.51 
 
 
119 aa  48.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3972  transposase IS3/IS911 family protein  36.59 
 
 
283 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  47.06 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4780  transposase IS3/IS911 family protein  54.76 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248666  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  27.69 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  39.06 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  39.06 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  34.27 
 
 
131 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>