259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6413 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 139 aa  273  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  56.9 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  56.9 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  61.47 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  56.03 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  55.17 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  55.17 
 
 		 135 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  58.18 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  49.14 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  49.14 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  49.14 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  47.41 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  47.41 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  47.41 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  47.41 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  47.41 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  47.41 
 
 		 121 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  48.28 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  48.28 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  45.22 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  50.93 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  46.55 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  46.09 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  46.09 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  46.09 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  46.09 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  45.54 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  46.09 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  46.09 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  46.09 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  46.6 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  41.88 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2541  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.901832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2332  ISRSO10-transposase ORFA protein  44.05 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  40.22 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  40.71 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  37.36 
 
 		 374 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 		 374 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 		 374 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  37.36 
 
 		 374 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  37.36 
 
 		 374 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  37.36 
 
 		 374 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  37.36 
 
 		 374 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  56 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  56 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  56 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  50.98 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  50.98 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  56 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  51.92 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  54 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  51.85 
 
 		 131 aa  57  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  51.85 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  51.85 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  51.61 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  48.15 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  50 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  50 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  49.09 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  41.27 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  41.27 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  30.17 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  30.17 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  30.17 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  30.17 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  44.07 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  30.56 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>