63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2332 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2332  ISRSO10-transposase ORFA protein  100 
 
 		 88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  98.86 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  98.86 
 
 		 122 aa  180  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  98.86 
 
 		 121 aa  179  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  94.32 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  88.64 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  88.64 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  88.64 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  88.64 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  88.64 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  88.64 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  81.82 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  75.86 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  75.86 
 
 		 133 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  75.86 
 
 		 133 aa  142  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  72.73 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  71.59 
 
 		 121 aa  136  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  72.41 
 
 		 133 aa  133  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  72.41 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  72.41 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  72.41 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  72.41 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  71.26 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  71.26 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  63.22 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  80.82 
 
 		 85 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  66.28 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  76.27 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  52.33 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  52.33 
 
 		 135 aa  93.2  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  52.33 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2541  transposase IS3/IS911 family protein  54.65 
 
 		 101 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.901832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  51.16 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  51.16 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0716  transposase  71.19 
 
 		 61 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  51.76 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  44.71 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  42.17 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  42.17 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  42.17 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  44.05 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  34.33 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  44.44 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  31.82 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>