More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3237 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
374 aa  738    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  738    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
374 aa  738    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
374 aa  738    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  738    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  738    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  738    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6125  integrase catalytic region  42.28 
 
 
289 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4975  integrase core subunit  40.45 
 
 
274 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  31.89 
 
 
382 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  31.89 
 
 
382 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  31.89 
 
 
382 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  31.89 
 
 
382 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  31.89 
 
 
382 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  31.89 
 
 
382 aa  180  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 
382 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 
378 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 
378 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 
378 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  33.78 
 
 
378 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 
382 aa  177  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  31.35 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  31.72 
 
 
382 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  32.78 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  32.78 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  38.04 
 
 
290 aa  160  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0378  integrase catalytic region  40.3 
 
 
286 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6050  integrase catalytic region  40.3 
 
 
286 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6485  integrase catalytic region  40.3 
 
 
286 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2570  integrase catalytic region  40.3 
 
 
286 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0561673  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6112  integrase catalytic region  40.3 
 
 
286 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116632  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1393  Integrase catalytic region  40.15 
 
 
271 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2887  Integrase catalytic region  40.15 
 
 
271 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  29.92 
 
 
392 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  29.92 
 
 
392 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0340  integrase catalytic region  37.59 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0840  integrase catalytic region  37.59 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.249045 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  29.92 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1943  integrase catalytic region  37.22 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2002  integrase catalytic region  37.22 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0552  integrase catalytic region  37.59 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.602741  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0452  integrase catalytic region  37.59 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  38.29 
 
 
276 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3730  integrase catalytic region  37.59 
 
 
286 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4250  integrase catalytic region  37.22 
 
 
286 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3599  integrase catalytic region  37.22 
 
 
286 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1105  integrase catalytic region  37.22 
 
 
286 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.361745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1032  integrase catalytic region  37.22 
 
 
286 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4229  integrase catalytic region  37.22 
 
 
286 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4972  integrase catalytic region  37.22 
 
 
286 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.422508  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3274  integrase catalytic region  37.22 
 
 
286 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  37.68 
 
 
307 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  37.68 
 
 
306 aa  151  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  37.68 
 
 
307 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0514  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
285 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0519  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
285 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0693  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
285 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0702  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
285 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0706  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
285 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0708  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
285 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2398  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
285 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2400  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
285 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3189  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
285 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3353  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
285 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.746992  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4118  integrase catalytic subunit  37.26 
 
 
285 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  37.68 
 
 
306 aa  151  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  37.68 
 
 
306 aa  151  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  33.85 
 
 
295 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
386 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
386 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
386 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
386 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
386 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
386 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
386 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
386 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
386 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  31.48 
 
 
386 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  31.48 
 
 
386 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1212  integrase catalytic region  34.07 
 
 
278 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  36.52 
 
 
293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0953  transposase IS3/IS911 family protein  29.97 
 
 
393 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3934  transposase IS3/IS911 family protein  29.97 
 
 
390 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000580476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1444  transposase IS3/IS911 family protein  29.97 
 
 
390 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3173  transposase IS3/IS911 family protein  29.97 
 
 
390 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  31.48 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  31.48 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  31.48 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  31.48 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  31.48 
 
 
386 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  38.43 
 
 
307 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4851  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  31.54 
 
 
379 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2730  Integrase catalytic region  34.89 
 
 
308 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  37.24 
 
 
245 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  34.6 
 
 
276 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  38.43 
 
 
288 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  31.5 
 
 
278 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  31.5 
 
 
278 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  31.5 
 
 
278 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  31.5 
 
 
278 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>