More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4855 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  100 
 
 
133 aa  263  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
133 aa  263  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  99.25 
 
 
133 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  99.25 
 
 
133 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  99.25 
 
 
133 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  99.25 
 
 
133 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  98.5 
 
 
133 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  81.2 
 
 
133 aa  214  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  81.2 
 
 
133 aa  214  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  82.95 
 
 
133 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  72.5 
 
 
136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  72.5 
 
 
136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  72.5 
 
 
136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  72.5 
 
 
136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  72.5 
 
 
136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  72.5 
 
 
136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  71.79 
 
 
121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  71.79 
 
 
121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  71.79 
 
 
121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  71.79 
 
 
121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  71.79 
 
 
121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  71.79 
 
 
121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  73.73 
 
 
121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  67.77 
 
 
122 aa  170  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  67.77 
 
 
122 aa  170  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  67.77 
 
 
121 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  72.88 
 
 
121 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  66.94 
 
 
122 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  64.46 
 
 
121 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  66.96 
 
 
122 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  67.62 
 
 
135 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2332  ISRSO10-transposase ORFA protein  71.26 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  54.47 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  50.41 
 
 
125 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  76.32 
 
 
85 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0716  transposase  95.08 
 
 
61 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  50.41 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  50.41 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  50.41 
 
 
135 aa  110  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  49.59 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  49.59 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  45.53 
 
 
129 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  49.6 
 
 
131 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  49.6 
 
 
131 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  49.6 
 
 
131 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  46.09 
 
 
139 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2541  transposase IS3/IS911 family protein  62.79 
 
 
101 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.901832  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  39.22 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  56.6 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  50.85 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  37.8 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  41.89 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  41.89 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  50.77 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  57.14 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  40.2 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  40.2 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  41.46 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  51.92 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  36.62 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  45.07 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  48.39 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  36.62 
 
 
225 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  36.62 
 
 
225 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  36.62 
 
 
225 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  48.39 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  36.62 
 
 
225 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  48.39 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  48.39 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  48.39 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  36.62 
 
 
225 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  48.39 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  36.62 
 
 
225 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  41.98 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  56.82 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  38.36 
 
 
224 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>