185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1220 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
156 aa  307  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
156 aa  307  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  97.5 
 
 
160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  81.41 
 
 
152 aa  245  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  76.28 
 
 
152 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  76.28 
 
 
152 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  76.28 
 
 
152 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  40.8 
 
 
113 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  37.21 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  38.67 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  38.67 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  37.21 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  39.1 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  37.4 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  37.4 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  37.4 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  32.21 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  40.31 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  35.92 
 
 
136 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  45.21 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  39.55 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 
141 aa  57.8  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  51.85 
 
 
129 aa  57.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  31.71 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  50 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  36.71 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  41.25 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  39.51 
 
 
107 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  31.45 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  31.45 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  38.98 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  32.26 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  46 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  29.55 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6197  transposase IS3/IS911 family protein  41.1 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.578613  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  31.45 
 
 
135 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  35.45 
 
 
131 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 
140 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 
140 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 
140 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 
140 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 
140 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  31.62 
 
 
140 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  31.62 
 
 
140 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  31.62 
 
 
140 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  31.62 
 
 
140 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  31.62 
 
 
140 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  31.62 
 
 
140 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6460  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4652  transposase IS3/IS911 family protein  33.88 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.110926  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  38.89 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  35.25 
 
 
135 aa  51.2  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 
128 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  37.65 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  47.06 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  47.06 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  47.06 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  47.06 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  47.06 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  47.06 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0779  hypothetical protein  42.86 
 
 
74 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 
149 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4029  hypothetical protein  40.57 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.64412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  42.59 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  42.59 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4875  transposase IS3/IS911 family protein  35.9 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.64301  normal  0.539748 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  29.92 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  34.45 
 
 
131 aa  48.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6122  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 
86 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  45.1 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  45.1 
 
 
122 aa  47.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  45.1 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  45.1 
 
 
122 aa  47.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4780  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248666  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  30.91 
 
 
128 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  26.14 
 
 
145 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4987  putative insertion sequence transposase protein  31.96 
 
 
113 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  25.23 
 
 
135 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  25.23 
 
 
135 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  25.23 
 
 
135 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  30.19 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  30.19 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  43.08 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  32.77 
 
 
110 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  27.54 
 
 
224 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  25.23 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  30.19 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  29.7 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  29.7 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  31.4 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1624  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  30.93 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  44.23 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>