66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2541 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2541  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
101 aa  201  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.901832  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
136 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
136 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
136 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
136 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
136 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
136 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  65.12 
 
 
121 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  55.1 
 
 
121 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  55.1 
 
 
122 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  55.1 
 
 
122 aa  107  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  62.79 
 
 
121 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  62.79 
 
 
121 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  62.79 
 
 
121 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  62.79 
 
 
121 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  62.79 
 
 
121 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  62.79 
 
 
121 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  56.12 
 
 
122 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  55.1 
 
 
122 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  55.1 
 
 
121 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  62.79 
 
 
133 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  62.79 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  62.79 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  62.79 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  62.79 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  62.79 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  62.79 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  62.65 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  62.65 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  61.45 
 
 
133 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2332  ISRSO10-transposase ORFA protein  54.65 
 
 
88 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  52.56 
 
 
125 aa  88.6  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  53.33 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  54.88 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  51.55 
 
 
135 aa  87  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  51.55 
 
 
135 aa  87  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  50.52 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  50.52 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  58.67 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  55.56 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  42.17 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  38.2 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0716  transposase  70.21 
 
 
61 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  45.83 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  56.76 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  30.12 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  30.12 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  58.06 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  35.63 
 
 
99 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>