246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0741 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  97.71 
 
 		 131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  97.71 
 
 		 131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  55.46 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  58.18 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  53.85 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  53.85 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  52.99 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  52.99 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  52.99 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  48.33 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  49.15 
 
 		 158 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  45.3 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  45.3 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  45.3 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  45.3 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  45.3 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  45.3 
 
 		 121 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  49.6 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  49.6 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  49.6 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  49.6 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  49.6 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  49.6 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  49.6 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  43.8 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  43.8 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.38 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.38 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  41.38 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  43.97 
 
 		 121 aa  94.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  40.52 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  38.89 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  39.45 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  40 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  35.51 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2332  ISRSO10-transposase ORFA protein  42.17 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 374 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 374 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 374 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2541  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.901832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  52.83 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  36.17 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  42.67 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3198  transposase IS3/IS911 family protein  45.57 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  52.17 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  31.58 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4399  transposase IS3/IS911 family protein  46.27 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134241  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3698  hypothetical protein  46.27 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.451428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  31 
 
 		 382 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2699  transposase IS3/IS911 family protein  31 
 
 		 390 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1804  transposase IS3/IS911 family protein  46.27 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  31 
 
 		 382 aa  53.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  31 
 
 		 382 aa  53.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  50.98 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 382 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 382 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  50.98 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 382 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 382 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 382 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 382 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  46.55 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>