More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2663 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
134 aa  268  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
134 aa  268  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
134 aa  268  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
134 aa  268  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  68.52 
 
 
124 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  68.52 
 
 
124 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  68.52 
 
 
124 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  63.39 
 
 
124 aa  156  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  64.22 
 
 
124 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  64.22 
 
 
124 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  64.22 
 
 
124 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  64.22 
 
 
124 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  64.22 
 
 
124 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  64.22 
 
 
124 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  64.22 
 
 
124 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  64.22 
 
 
124 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  63.39 
 
 
121 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  62.5 
 
 
124 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  62.5 
 
 
124 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  61.4 
 
 
128 aa  153  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  65.09 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  63.16 
 
 
129 aa  150  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  65.38 
 
 
109 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  63.46 
 
 
124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  63.46 
 
 
124 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  63.46 
 
 
124 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  63.46 
 
 
124 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  53.51 
 
 
125 aa  140  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  55.79 
 
 
99 aa  121  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  67.24 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4724  transposase IS3/IS911  68 
 
 
71 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240633  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2450  transposase IS3/IS911  63.46 
 
 
57 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5095  hypothetical protein  61.54 
 
 
57 aa  67  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.72528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  58.33 
 
 
53 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5091  hypothetical protein  58 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.774813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2349  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0590216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  35.16 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  42.86 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  35.87 
 
 
374 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  35.87 
 
 
374 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  35.87 
 
 
374 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 
374 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  35.87 
 
 
374 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  35.87 
 
 
374 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 
374 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_002936  DET0083  ISDet1, transposase orfA  36.96 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.376944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  32.99 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  32.99 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  32.99 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  32.99 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  32.99 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  29.31 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0537  putative transposase  29.59 
 
 
102 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1352  putative transposase  29.59 
 
 
102 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1382  putative transposase or inactivated derivative  29.59 
 
 
102 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 
131 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  42.42 
 
 
131 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2124  putative transposase  30.11 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  31.11 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  31.11 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1842  transposase IS3/IS911 family protein  30.61 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1457  transposase IS3/IS911 family protein  31.18 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080676  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0065  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  35.87 
 
 
97 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  27.73 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  27.73 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1618  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1646  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  28.04 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  26.67 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2013  transposase IS3/IS911  35.87 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00189647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1692  transposase IS3/IS911  35.87 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.325728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1686  transposase IS3/IS911  35.87 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1887  transposase IS3/IS911  35.87 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1880  transposase IS3/IS911  35.87 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1682  transposase IS3/IS911  35.87 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1675  transposase IS3/IS911  35.87 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2001  transposase IS3/IS911  35.87 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>