175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0590 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  100 
 
 
97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0586  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0920  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1657  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.803884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1662  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1673  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1675  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1682  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1686  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1692  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.325728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1880  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1887  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1975  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1992  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2001  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2013  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00189647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2136  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2772  transposase IS3/IS911  98.97 
 
 
97 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  61 
 
 
382 aa  120  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
382 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2699  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
390 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
382 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  60.22 
 
 
382 aa  116  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2230  transposase IS3/IS911  42.71 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000508714 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0995  transposase IS3/IS911  45.16 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
96 aa  82.8  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0744  transposase IS3/IS911  51.39 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
96 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1144  transposase IS3/IS911 family protein  38.04 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3029  hypothetical protein  42.55 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1903  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3664  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 
95 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1305  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1759  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1955  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2113  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0939  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0773  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1894  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1295  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  41.11 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1881  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0136  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0185  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.204073  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0237  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
369 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06081  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06182  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05659  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02887  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
369 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02814  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05741  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05751  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06015  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05649  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05620  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08182  transposase  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000279853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01093  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01502  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01667  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01863  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01947  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02147  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02413  hypothetical protein  35.48 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02439  hypothetical protein  35.48 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2729  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0430  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5484  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5642  transposase IS3/IS911 family protein  39.33 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08186  transposase  34.41 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.0000609698  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02326  hypothetical protein  35.71 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0078  transposase IS3/IS911 family protein  38.38 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803962  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0540  putative transposase  35.56 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3075  transposase IS3/IS911 family protein  34.74 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1306  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1654  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1712  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2284  transposase IS3/IS911  32.61 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2105  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 
75 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0019  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3396  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  34.52 
 
 
91 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6985  transposase IS3/IS911 family protein  36.59 
 
 
98 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345794  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0082  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0293  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0976  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.163321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1326  transposase IS3/IS911 family protein  34.04 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0172705  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1413  transposase IS3/IS911 family protein  37.84 
 
 
82 aa  57  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0015724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1539  transposase  33.7 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0203174  normal  0.231759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1736  transposase  35.96 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>