245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5452 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 124 aa  243  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 124 aa  243  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  92.74 
 
 		 124 aa  225  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  80.65 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  80.65 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  80.65 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  82.79 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  79.84 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  79.84 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  81.97 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  79.84 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  79.84 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  79.84 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  81.97 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  82.35 
 
 		 121 aa  199  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  78.29 
 
 		 129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  80.83 
 
 		 133 aa  194  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  76.86 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  76.86 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  77.5 
 
 		 128 aa  182  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  85.98 
 
 		 109 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  76.67 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  73.77 
 
 		 124 aa  181  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  72.17 
 
 		 125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  68.52 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  68.52 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  68.52 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  68.52 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  79.55 
 
 		 99 aa  147  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  79.41 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4724  transposase IS3/IS911  67.69 
 
 		 71 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240633  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2450  transposase IS3/IS911  78.18 
 
 		 57 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5095  hypothetical protein  78.18 
 
 		 57 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.72528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  69.23 
 
 		 53 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5091  hypothetical protein  80 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.774813 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  34.78 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  34.78 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  34.78 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  34.78 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  43.1 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  38.04 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1842  transposase IS3/IS911 family protein  29.59 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  31.46 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0537  putative transposase  27.55 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1352  putative transposase  27.55 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1382  putative transposase or inactivated derivative  27.55 
 
 		 102 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1370  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.885273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3375  hypothetical protein  81.25 
 
 		 43 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  32.99 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  32.99 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  31.96 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  32.94 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0540  putative transposase  33.77 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2124  putative transposase  26.88 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  32.94 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  32.94 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5642  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1646  transposase IS3/IS911 family protein  26.53 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5484  transposase IS3/IS911 family protein  30 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0083  ISDet1, transposase orfA  33.33 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.376944  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  32.91 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  32.91 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  32.91 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2349  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0590216  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  33.67 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  32.94 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  33.67 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  33.67 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  33.67 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>