51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3375 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3375  hypothetical protein  100 
 
 
43 aa  84.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422861  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2450  transposase IS3/IS911  100 
 
 
57 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  93.75 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5095  hypothetical protein  93.75 
 
 
57 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.72528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  90.62 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  87.5 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  66.67 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  84.38 
 
 
124 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  83.87 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  78.12 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  81.25 
 
 
124 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  81.25 
 
 
124 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  75 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  75 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  75 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  71.88 
 
 
124 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
134 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
134 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
134 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
134 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>