85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2349 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2349  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
89 aa  184  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0590216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  37.8 
 
 
374 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 
374 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 
374 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  37.8 
 
 
374 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 
374 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  37.8 
 
 
374 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  37.8 
 
 
374 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  35.37 
 
 
95 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  37.21 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  37.65 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  30.95 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  30.95 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  33.72 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  37.65 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  37.65 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  37.65 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  37.65 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  37.65 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  37.65 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  37.65 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  37.65 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1894  transposase IS3/IS911 family protein  33.73 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0939  transposase IS3/IS911 family protein  33.73 
 
 
97 aa  47.4  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  37.65 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  37.65 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  29.76 
 
 
96 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  30.49 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3385  putative transposase  46.94 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1955  transposase IS3/IS911 family protein  32.53 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2113  transposase IS3/IS911 family protein  32.53 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1305  transposase IS3/IS911 family protein  32.53 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  34.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1903  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1759  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 
97 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  35.56 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3642  hypothetical protein  31.71 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0363388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0035  transposase subfamily protein  31.71 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0193883  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0237  transposase IS3/IS911 family protein  29.63 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0633  transposase subfamily protein  31.71 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3878  transposase subfamily protein  31.33 
 
 
87 aa  42  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1295  transposase IS3/IS911 family protein  31.33 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  36.36 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  36.36 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  36.36 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0078  transposase IS3/IS911 family protein  28.92 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803962  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3664  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  30.59 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2105  transposase IS3/IS911 family protein  31.94 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3029  hypothetical protein  25.3 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1332  putative transposase IS3/IS911  29.27 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  37.1 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1881  transposase IS3/IS911 family protein  28.92 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0185  transposase IS3/IS911 family protein  28.92 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.204073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0136  transposase IS3/IS911 family protein  28.92 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1539  transposase  29.63 
 
 
96 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0203174  normal  0.231759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>