169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1539 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1539  transposase  100 
 
 		 96 aa  189  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0203174  normal  0.231759 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5484  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5642  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4204  transposase IS3/IS911 family protein  48.96 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0540  putative transposase  50 
 
 		 97 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06182  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06081  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05659  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05649  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05620  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05751  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05741  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06015  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1736  transposase  49.45 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02814  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02887  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08182  transposase  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000279853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01093  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01502  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01667  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01863  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01947  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02147  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02413  hypothetical protein  53.06 
 
 		 93 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0202  putative transposase  48.35 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1692  transposase  48.35 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08186  transposase  52.04 
 
 		 93 aa  87.8  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.0000609698  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02439  hypothetical protein  52.69 
 
 		 96 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  45.65 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02326  hypothetical protein  48.94 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  48.81 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  46.67 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4376  transposase IS3/IS911  40.62 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4500  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1306  transposase IS3/IS911  47.87 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1654  transposase IS3/IS911  47.87 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1712  transposase IS3/IS911  47.87 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2284  transposase IS3/IS911  47.87 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2729  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0185  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.204073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0136  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1881  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3396  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0019  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 		 382 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0773  transposase IS3/IS911 family protein  41.3 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3075  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 382 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3029  hypothetical protein  37.89 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 382 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0082  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0293  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0976  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.163321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1326  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0172705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 382 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 382 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 382 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 382 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 382 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 382 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3664  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6985  transposase IS3/IS911 family protein  41.49 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 		 382 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0237  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2431  putative transposase  44.87 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2699  transposase IS3/IS911 family protein  40.22 
 
 		 390 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0078  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1611  IS3 family transposase orfA  42.86 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1457  hypothetical protein  41.89 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6609  transposase and inactivated derivatives  52.54 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.580446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0430  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1295  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 97 aa  62  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1144  transposase IS3/IS911 family protein  35.96 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1894  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0939  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1305  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1903  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1759  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2230  transposase IS3/IS911  30.43 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000508714 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1955  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2113  transposase IS3/IS911 family protein  34.41 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0586  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1675  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1682  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1686  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1692  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.325728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1880  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1887  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1975  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1992  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2001  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2013  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00189647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2136  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2772  transposase IS3/IS911  33.7 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>