134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2105 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2105  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
75 aa  152  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0939  transposase IS3/IS911 family protein  98.67 
 
 
97 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1305  transposase IS3/IS911 family protein  98.67 
 
 
97 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1759  transposase IS3/IS911 family protein  98.67 
 
 
97 aa  151  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1894  transposase IS3/IS911 family protein  98.67 
 
 
97 aa  152  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1903  transposase IS3/IS911 family protein  98.67 
 
 
97 aa  151  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1955  transposase IS3/IS911 family protein  97.33 
 
 
97 aa  149  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2113  transposase IS3/IS911 family protein  97.33 
 
 
97 aa  149  8.999999999999999e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1295  transposase IS3/IS911 family protein  97.33 
 
 
97 aa  149  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1881  transposase IS3/IS911 family protein  69.33 
 
 
97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0136  transposase IS3/IS911 family protein  69.33 
 
 
97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0185  transposase IS3/IS911 family protein  69.33 
 
 
97 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.204073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2729  transposase IS3/IS911 family protein  69.33 
 
 
97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3029  hypothetical protein  68 
 
 
97 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0078  transposase IS3/IS911 family protein  64 
 
 
97 aa  103  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803962  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0430  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
99 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0583  transposase IS3/IS911 family protein  94.87 
 
 
68 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1692  transposase  44 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0202  putative transposase  44 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00346911  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1736  transposase  44 
 
 
102 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4204  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0237  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 
94 aa  72  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  53.33 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0540  putative transposase  47.37 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3664  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  40.3 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4376  transposase IS3/IS911  41.33 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4500  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0586  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0920  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1657  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.803884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1662  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1673  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1675  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1682  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1686  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1692  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.325728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1880  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1887  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1975  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1992  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2001  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2013  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00189647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2136  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2772  transposase IS3/IS911  52.83 
 
 
97 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2431  putative transposase  46.88 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4252  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6609  transposase and inactivated derivatives  45.61 
 
 
63 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.580446  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5484  transposase IS3/IS911 family protein  45.59 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5642  transposase IS3/IS911 family protein  45.59 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  45.59 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  50.94 
 
 
97 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1144  transposase IS3/IS911 family protein  47.27 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1306  transposase IS3/IS911  41.27 
 
 
100 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1654  transposase IS3/IS911  41.27 
 
 
100 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1712  transposase IS3/IS911  41.27 
 
 
100 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2284  transposase IS3/IS911  41.27 
 
 
100 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  41.43 
 
 
91 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0082  transposase IS3/IS911 family protein  43.08 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0293  transposase IS3/IS911 family protein  43.08 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0976  transposase IS3/IS911 family protein  43.08 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.163321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1326  transposase IS3/IS911 family protein  43.08 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0172705  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08186  transposase  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.0000609698  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08182  transposase  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000279853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01093  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01502  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01667  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01863  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01947  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02147  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02413  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02439  hypothetical protein  42.59 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02814  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02887  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05620  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05649  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05659  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05741  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05751  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06015  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06081  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06182  hypothetical protein  42.59 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02326  hypothetical protein  42.59 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0773  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0019  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3396  transposase IS3/IS911 family protein  42.59 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 
96 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 
96 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 
96 aa  55.1  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3075  transposase IS3/IS911 family protein  46.3 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1611  IS3 family transposase orfA  42.31 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2230  transposase IS3/IS911  40.38 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000508714 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6985  transposase IS3/IS911 family protein  38.33 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345794  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1539  transposase  35.48 
 
 
96 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0203174  normal  0.231759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0744  transposase IS3/IS911  41.51 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1620  hypothetical protein  39.29 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.35757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1413  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0015724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0995  transposase IS3/IS911  37.5 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0351  hypothetical protein  40.91 
 
 
44 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43929  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3739  transposase IS3/IS911 family protein  32.84 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>