135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0185 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1881  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0185  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.204073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0136  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2729  transposase IS3/IS911 family protein  98.97 
 
 
97 aa  192  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0078  transposase IS3/IS911 family protein  77.08 
 
 
97 aa  158  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803962  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0939  transposase IS3/IS911 family protein  73.91 
 
 
97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1894  transposase IS3/IS911 family protein  73.91 
 
 
97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1305  transposase IS3/IS911 family protein  73.91 
 
 
97 aa  144  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1955  transposase IS3/IS911 family protein  73.91 
 
 
97 aa  144  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2113  transposase IS3/IS911 family protein  73.91 
 
 
97 aa  144  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1759  transposase IS3/IS911 family protein  73.91 
 
 
97 aa  144  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1903  transposase IS3/IS911 family protein  73.91 
 
 
97 aa  144  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1295  transposase IS3/IS911 family protein  72.83 
 
 
97 aa  142  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3029  hypothetical protein  67.37 
 
 
97 aa  141  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0430  transposase IS3/IS911 family protein  69.15 
 
 
99 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.700333  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2105  transposase IS3/IS911 family protein  69.33 
 
 
75 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1736  transposase  47.96 
 
 
102 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4204  transposase IS3/IS911 family protein  47.87 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1692  transposase  45.92 
 
 
121 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0202  putative transposase  45.92 
 
 
121 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3664  transposase IS3/IS911 family protein  47.87 
 
 
95 aa  90.1  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0583  transposase IS3/IS911 family protein  75.44 
 
 
68 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0237  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 
94 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  42.55 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1144  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3075  transposase IS3/IS911 family protein  46.74 
 
 
116 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0019  transposase IS3/IS911 family protein  48.45 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3396  transposase IS3/IS911 family protein  48.45 
 
 
101 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4376  transposase IS3/IS911  43.62 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4500  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0773  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1539  transposase  42.71 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0203174  normal  0.231759 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0082  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0293  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0976  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.163321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1326  transposase IS3/IS911 family protein  45.56 
 
 
94 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0172705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2230  transposase IS3/IS911  38.3 
 
 
96 aa  72.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000508714 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08182  transposase  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000279853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01093  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01502  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01667  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01863  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01947  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02147  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02413  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02814  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02887  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05620  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05649  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05659  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05741  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05751  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06015  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06081  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06182  hypothetical protein  43.01 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2431  putative transposase  38.71 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4252  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02439  hypothetical protein  43.01 
 
 
96 aa  72  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6609  transposase and inactivated derivatives  54.39 
 
 
63 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.580446  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6985  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345794  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0586  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0920  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1657  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.803884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1662  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1673  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1675  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1682  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1686  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1692  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.325728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1880  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1887  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1975  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1992  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2001  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2013  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00189647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2136  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2772  transposase IS3/IS911  41.05 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  40.66 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  42.86 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0995  transposase IS3/IS911  35.79 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5484  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5642  transposase IS3/IS911 family protein  40.45 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08186  transposase  41.94 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.0000609698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  40 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1306  transposase IS3/IS911  37.93 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1654  transposase IS3/IS911  37.93 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1712  transposase IS3/IS911  37.93 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2284  transposase IS3/IS911  37.93 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02326  hypothetical protein  40.91 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1611  IS3 family transposase orfA  39.8 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2623  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
369 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.730689  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2025  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
369 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.40416  normal  0.768967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0540  putative transposase  36.26 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1457  hypothetical protein  39.02 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178192  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1413  transposase IS3/IS911 family protein  48.21 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0015724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
382 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>