219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0540 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0540  putative transposase  100 
 
 		 97 aa  200  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5484  transposase IS3/IS911 family protein  59.14 
 
 		 94 aa  120  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  59.14 
 
 		 94 aa  120  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5642  transposase IS3/IS911 family protein  59.14 
 
 		 94 aa  120  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3362  transposase (class V)  53.19 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  58.54 
 
 		 91 aa  103  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2431  putative transposase  53.12 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01947  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02814  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02147  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06182  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06081  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02439  hypothetical protein  50.55 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02413  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05751  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05741  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05659  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08182  transposase  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000279853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01667  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01502  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01093  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01863  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06015  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02887  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0237  transposase IS3/IS911 family protein  43.96 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05649  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05620  hypothetical protein  50.55 
 
 		 93 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08186  transposase  49.45 
 
 		 93 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.0000609698  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3664  transposase IS3/IS911 family protein  50.55 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4204  transposase IS3/IS911 family protein  47.96 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1539  transposase  50 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0203174  normal  0.231759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1306  transposase IS3/IS911  47.25 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.273765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1654  transposase IS3/IS911  47.25 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1712  transposase IS3/IS911  47.25 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2284  transposase IS3/IS911  47.25 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02326  hypothetical protein  46.59 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1736  transposase  45.83 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5937  transposase IS3/IS911  44.79 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653759  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0202  putative transposase  43.16 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1692  transposase  43.16 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4500  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4376  transposase IS3/IS911  42.71 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1326  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0172705  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0976  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.163321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0293  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0082  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1666  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 		 382 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2699  transposase IS3/IS911 family protein  42.39 
 
 		 390 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1300  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.161562  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3396  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0019  transposase IS3/IS911 family protein  43.53 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0405  transposase IS3/IS911 family protein  41.84 
 
 		 382 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2620  transposase IS3/IS911 family protein  41.84 
 
 		 382 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0824  transposase IS3/IS911 family protein  41.84 
 
 		 382 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2361  transposase IS3/IS911 family protein  41.84 
 
 		 382 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00134936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2702  transposase IS3/IS911 family protein  41.84 
 
 		 382 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2178  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 		 382 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.322706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0843  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 		 382 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0839  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 		 382 aa  77  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0117818  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0939  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1894  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1903  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.416601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1759  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1305  transposase IS3/IS911 family protein  41.76 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0773  transposase IS3/IS911 family protein  43.43 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.39135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1955  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2113  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1295  transposase IS3/IS911 family protein  40.66 
 
 		 97 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3075  transposase IS3/IS911 family protein  44.71 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000237827 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6985  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.345794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2230  transposase IS3/IS911  36.26 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000508714 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0995  transposase IS3/IS911  35.16 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1457  hypothetical protein  45.78 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1144  transposase IS3/IS911 family protein  42.05 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0078  transposase IS3/IS911 family protein  36.17 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2105  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3029  hypothetical protein  37.36 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1611  IS3 family transposase orfA  40.28 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0136  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0185  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.204073  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1881  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  35.56 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2729  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1673  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1675  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1682  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1686  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1692  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.325728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1880  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1887  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1975  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1992  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2001  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2013  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00189647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2136  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2772  transposase IS3/IS911  34.44 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>