More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2927 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  94.32 
 
 
88 aa  176  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  69.32 
 
 
88 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  69.32 
 
 
88 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  69.32 
 
 
88 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  68.97 
 
 
88 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  68.18 
 
 
88 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  66.67 
 
 
88 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  66.67 
 
 
88 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  66.67 
 
 
88 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  66.67 
 
 
88 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  64.77 
 
 
88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  67.86 
 
 
85 aa  127  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0643  putative transposase  66.67 
 
 
99 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.6553  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  65.91 
 
 
88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 
88 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 
88 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 
88 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  67.82 
 
 
88 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 
88 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  67.82 
 
 
88 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 
88 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  64.37 
 
 
88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
88 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  56.82 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  56.82 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1694  transposase IS3/IS911  56.82 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  56.82 
 
 
92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3127  transposase IS3/IS911  55.17 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.800536  normal  0.701441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3534  transposase IS3/IS911  55.17 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.545436  normal  0.522486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2969  transposase IS3/IS911  55.17 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 
88 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  55.68 
 
 
92 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1495  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  55.68 
 
 
88 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  55.68 
 
 
88 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  55.68 
 
 
88 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4237  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
92 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219099  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3246  transposase IS3/IS911  54.02 
 
 
88 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00639582  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4006  transposase IS3/IS911 family protein  54.55 
 
 
88 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04442  isrso16-transposase orfa protein  54.02 
 
 
88 aa  103  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 
88 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 
88 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 
88 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  51.14 
 
 
88 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  51.14 
 
 
88 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  51.14 
 
 
88 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0165  ISDet2, transposase orfA  50 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.265769  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2542  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  52.27 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
88 aa  98.6  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
88 aa  98.6  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7752  putative insertion element ISR1-like protein  50.57 
 
 
88 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619622  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0375  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
87 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000436145  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  52.27 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  52.27 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
88 aa  98.6  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
100 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0026  transposase subfamily  51.16 
 
 
87 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138106  normal  0.472585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2559  transposase IS3/IS911  55.29 
 
 
86 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0007  transposase IS3/IS911 family protein  55.29 
 
 
86 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1332  transposase IS3/IS911-family  52.87 
 
 
92 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_64  transposase IS3/IS911-family  52.87 
 
 
92 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1309  transposase IS3/IS911-family  52.87 
 
 
92 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_777  transposase IS3/IS911-family  52.87 
 
 
92 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_89  transposase IS3/IS911-family  52.87 
 
 
92 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4079  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
87 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2044  transposase IS3/IS911  48.86 
 
 
106 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  54.76 
 
 
393 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
370 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
370 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
370 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
370 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
370 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
370 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
370 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
88 aa  94  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
88 aa  94  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
88 aa  94  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7692  insertion element protein  48.86 
 
 
152 aa  94  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382154  normal  0.307817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>