71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4399 on replicon NC_009433
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009433  Rsph17025_4399  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134241  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3698  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.451428 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1804  transposase IS3/IS911 family protein  97.73 
 
 		 144 aa  255  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3198  transposase IS3/IS911 family protein  83.7 
 
 		 135 aa  210  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4110  hypothetical protein  73.33 
 
 		 133 aa  184  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8376  transposase IS3/IS911 family protein  39.83 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  38.28 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  38.28 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2997  transposase IS3/IS911  37.93 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294595  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  34.71 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  34.71 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  34.71 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1582  hypothetical protein  41.96 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.447037 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  37.4 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  46.27 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  46.27 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  46.27 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  31.62 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  40.7 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  41.43 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  41.43 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  41.43 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  41.03 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  54.72 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4930  hypothetical protein  53.85 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.527295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  32.62 
 
 		 168 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  47.54 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  38.27 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  34.65 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  32.06 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  40.3 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  40.3 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0709  transposase IS3/IS911 family protein  35.05 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.668336  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  36.17 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  36.17 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  35.85 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  39.06 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  36.17 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  29.23 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  40 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  40 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  38.71 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  38.71 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  38.71 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  33.88 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  33.61 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  33.72 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  38.57 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4915  transposase IS3/IS911 family protein  30.33 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.269908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  33.72 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  37.66 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  37.1 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  33.72 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  33.72 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  33.72 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  33.72 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  33.72 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  42.37 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  29.41 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 121 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>