122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2169 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  100 
 
 
154 aa  316  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  75.21 
 
 
121 aa  180  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  69.67 
 
 
122 aa  174  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  69.67 
 
 
122 aa  174  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  70.25 
 
 
121 aa  173  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  69.67 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  66.94 
 
 
121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  66.94 
 
 
121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  66.94 
 
 
121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  66.94 
 
 
121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  66.94 
 
 
121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  66.94 
 
 
121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  56.82 
 
 
133 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  56.82 
 
 
133 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  56.06 
 
 
133 aa  140  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  64.71 
 
 
135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  51.94 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  51.94 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  51.94 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  51.94 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  51.94 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  51.94 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  54.31 
 
 
121 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  54.31 
 
 
121 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  55.28 
 
 
133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  55.28 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  55.28 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  55.28 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  55.28 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  54.47 
 
 
133 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  54.47 
 
 
133 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2332  ISRSO10-transposase ORFA protein  66.28 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  50.42 
 
 
122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  44.26 
 
 
125 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  42.4 
 
 
129 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  44.17 
 
 
141 aa  99.4  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  64 
 
 
85 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  44.17 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  44.17 
 
 
135 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  43.33 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  43.33 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2541  transposase IS3/IS911 family protein  54.88 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.901832  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  41.88 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  35.51 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  35.51 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  35.51 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  60 
 
 
68 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2335  remnant of ISRSO10-transposase protein  67.35 
 
 
51 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0716  transposase  52.46 
 
 
61 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  49.06 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  49.06 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  44.62 
 
 
168 aa  54.3  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  49.02 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  48.94 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  29.09 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
135 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  36.19 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  46.15 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  46.15 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  37.1 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25470  transposase IS3/IS911  57.69 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  37.33 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  43.4 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  41.1 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  44.83 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  44.83 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  44.83 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  44.83 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  44.83 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  44.83 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  44.83 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  55.56 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  46.81 
 
 
131 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  39.68 
 
 
119 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  49.02 
 
 
150 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  31.63 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  29.9 
 
 
224 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  46.43 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  41.43 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  34.78 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>