190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4274 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  100 
 
 
224 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  41.01 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  41.01 
 
 
225 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  41.01 
 
 
225 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  41.01 
 
 
225 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  41.01 
 
 
225 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  41.01 
 
 
225 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  43.61 
 
 
154 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0034  transposase  42.74 
 
 
111 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  34.97 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  34.27 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  37.86 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  37.86 
 
 
139 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  29.41 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  35.43 
 
 
120 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1391  IS66 family element, orf1  33.07 
 
 
120 aa  62  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0032  Aec51  41.54 
 
 
94 aa  61.6  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  43.84 
 
 
135 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  43.84 
 
 
135 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  43.84 
 
 
135 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  43.84 
 
 
135 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  30.4 
 
 
145 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  29.23 
 
 
133 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  29.23 
 
 
129 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  27.34 
 
 
133 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  37.74 
 
 
134 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  37.74 
 
 
134 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  38.57 
 
 
88 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  37.8 
 
 
133 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  44.23 
 
 
121 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  44.23 
 
 
121 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  44.23 
 
 
121 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  44.23 
 
 
121 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  44.23 
 
 
121 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  44.23 
 
 
121 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  42.31 
 
 
122 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  42.31 
 
 
121 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  42.31 
 
 
122 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 
126 aa  55.5  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  44.23 
 
 
122 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  46.81 
 
 
106 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  46.81 
 
 
106 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  46.81 
 
 
106 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  46.81 
 
 
106 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  46.81 
 
 
106 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  46.81 
 
 
106 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  43.64 
 
 
138 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 
133 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 
106 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  35.85 
 
 
134 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 
130 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  35.9 
 
 
133 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  35.9 
 
 
133 aa  53.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  43.4 
 
 
122 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  30.43 
 
 
131 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  28.35 
 
 
149 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 
121 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  32.93 
 
 
147 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5452  integrase catalytic region  35.56 
 
 
458 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 
133 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 
133 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  45.24 
 
 
133 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  40 
 
 
133 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
133 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 
133 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
125 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 
130 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 
133 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 
128 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  51.22 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  51.22 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  51.22 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  51.22 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  51.22 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  51.22 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  51.22 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  51.22 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  51.22 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  51.22 
 
 
135 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 
110 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  38.78 
 
 
132 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5413  integrase catalytic region  40.35 
 
 
385 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.694464 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  41.27 
 
 
510 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  41.27 
 
 
510 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  41.27 
 
 
510 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  41.27 
 
 
510 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>