106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2291 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 147 aa  292  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5995  hypothetical protein  84.72 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  41.22 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  41.22 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  34.15 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  37.16 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  35.76 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  33.8 
 
 		 167 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  31.94 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  37.11 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  35.44 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  33.12 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  35.44 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  35.44 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  35.44 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  36.17 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  36.17 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  38.14 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  35.11 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  30.57 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  37.41 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  30.77 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  40.58 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  40.58 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  32.93 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  33.64 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  33.64 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  39.24 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  33.64 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  33.64 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  33.64 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  33.64 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  51.22 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  33.64 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  34.07 
 
 		 136 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  32.39 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  33.04 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  52.83 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  34.78 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  50.94 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  36.51 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  28.57 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  40.68 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  36.59 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  28.57 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  39.62 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  44.44 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  45.9 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 114 aa  43.5  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  34.33 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  32.69 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  32.69 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  34.92 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  34.92 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  34.92 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  34.92 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  34.92 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  34.92 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  34.92 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  34.92 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  34.92 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  34.92 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  39.62 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  36.9 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  34.33 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0518  hypothetical protein  45.28 
 
 		 86 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  38.18 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  34.92 
 
 		 129 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  34.92 
 
 		 129 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  34.92 
 
 		 129 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  34.92 
 
 		 129 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  36.51 
 
 		 112 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  36.51 
 
 		 112 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  36.51 
 
 		 112 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  36.51 
 
 		 112 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  32.26 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  38.18 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  38.18 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  38.18 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  38.18 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  38.18 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  38.18 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  39.06 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  37.74 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  40.98 
 
 		 121 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>