188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3366 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  100 
 
 
225 aa  463  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  100 
 
 
225 aa  463  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  100 
 
 
225 aa  463  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  100 
 
 
225 aa  463  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  100 
 
 
225 aa  463  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  99.56 
 
 
225 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  100 
 
 
154 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0034  transposase  98.2 
 
 
111 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0032  Aec51  85.11 
 
 
94 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  41.01 
 
 
224 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  44.17 
 
 
133 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  43.2 
 
 
133 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  43.2 
 
 
129 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  38.52 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  37.78 
 
 
141 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  37.82 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  36.96 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  37.5 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  36.36 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  30.71 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  52.83 
 
 
133 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
128 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 
126 aa  62.4  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1391  IS66 family element, orf1  36.97 
 
 
120 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  40 
 
 
120 aa  62.4  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  30.83 
 
 
135 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
135 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  37.97 
 
 
135 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  37.97 
 
 
135 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  37.97 
 
 
135 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  38.24 
 
 
138 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  37.11 
 
 
131 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  51.22 
 
 
133 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
133 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  51.22 
 
 
133 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
133 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
133 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
133 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2813  transposase  30.83 
 
 
131 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
133 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1178  putative DNA-binding protein  31.16 
 
 
131 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  46 
 
 
121 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  46 
 
 
121 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  46 
 
 
121 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  46 
 
 
121 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  46 
 
 
121 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  46 
 
 
121 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  31.53 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  34.21 
 
 
133 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  36.76 
 
 
106 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  43.4 
 
 
122 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  44 
 
 
122 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  42 
 
 
133 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  42 
 
 
133 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  35.53 
 
 
125 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  36.25 
 
 
146 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  29.55 
 
 
131 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  32.5 
 
 
149 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  42 
 
 
122 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  42 
 
 
121 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  42 
 
 
122 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  36.76 
 
 
88 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  35.29 
 
 
106 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  35.29 
 
 
106 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  30.7 
 
 
138 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  35.29 
 
 
106 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  35.29 
 
 
106 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  35.29 
 
 
106 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
106 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  44.44 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  44.44 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  44.44 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  44.44 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  44.44 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  44.44 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
121 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
121 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  44.44 
 
 
121 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>