225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0663 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 128 aa  254  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  44.92 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  42.61 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  45.1 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  38.6 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  38.66 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2813  transposase  38.58 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  35.48 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  35.48 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  35.48 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  35.48 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  35.48 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  35.48 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  35.48 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  38.33 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  54.72 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  33.33 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  36.44 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  33.33 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  36.72 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1178  putative DNA-binding protein  40.35 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  35.83 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  35.83 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  35.83 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  35.83 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  35.83 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  35.83 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  35.83 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  35.83 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  35.83 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  35.83 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  31.97 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  31.97 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  31.97 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  35 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  35 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  35 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  35 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  35 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0034  transposase  36.19 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  35 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  34.02 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  50 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  50 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  50 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  50 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  50 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  50 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  33.88 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  33.96 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  55.32 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  48 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  33.96 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5541  hypothetical protein  59.09 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.60846 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  33.61 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  32.77 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  43.42 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  46 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  46 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  46 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  38.1 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  41.67 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  40 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  40.51 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  40.51 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  51.02 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  44 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  51.06 
 
 		 224 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  33.87 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  41.3 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  37.29 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  38.03 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  47.73 
 
 		 331 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>