138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0472 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  100 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  42.96 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  42.96 
 
 		 142 aa  100  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  44.7 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  37.82 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  37.82 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  37.82 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  37.82 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  37.82 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  37.82 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  37.82 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  40.38 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  38.6 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  34.21 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  33.33 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  37.38 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  34 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  33.66 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  34 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  30.77 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  38.32 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1391  IS66 family element, orf1  34.02 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  30.91 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  36.04 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  36.04 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  36.04 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  36.04 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  36.04 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  36.04 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  36.04 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  36.04 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  36.04 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  36.04 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0034  transposase  35 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  35.35 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  30 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  58.33 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  58.33 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  34.07 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  29.84 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  55.56 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  55.56 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  31.13 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  38.78 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  35.82 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2813  transposase  35.78 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  29.63 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  36.99 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  37.21 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  54.29 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  25 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  37.74 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  37.74 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  37.74 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  37.74 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  37.74 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  37.74 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  44.68 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  35.42 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  35.42 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  35.42 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  35.42 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  35.42 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  35.42 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  34.69 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  34.69 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  34.69 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  30.3 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  36.96 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  26.61 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  23.36 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  26.61 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  34.69 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1178  putative DNA-binding protein  35.51 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  28.69 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  28.69 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  33.96 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>