147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6579 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
159 aa  327  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  62.89 
 
 
159 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  48.1 
 
 
155 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  48.1 
 
 
174 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  48.1 
 
 
160 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  48.1 
 
 
160 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  43.4 
 
 
167 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  43.42 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  40.13 
 
 
159 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  43.33 
 
 
170 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  40.85 
 
 
164 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  40.4 
 
 
146 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  43.59 
 
 
155 aa  97.1  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  43.54 
 
 
152 aa  94.4  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  33.97 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  32.48 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  32.48 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  50.82 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  43.42 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  44.74 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  42.86 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  42.86 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  40.23 
 
 
110 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  54.72 
 
 
128 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  49.18 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  43.68 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  44.62 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  46.58 
 
 
127 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  39.68 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  38.89 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 
110 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  33.57 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  33.57 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  33.57 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  33.57 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  38.71 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  38.71 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  38.71 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  44.62 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  44.62 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  44.62 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 
130 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  33.57 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  44.62 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  40.32 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  39.68 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  39.68 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  32.35 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  32.35 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  32.35 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  32.35 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  32.35 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  32.35 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  32.35 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  32.35 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  32.35 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  32.35 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  32.35 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  39.08 
 
 
138 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  39.68 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  45 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  51.11 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  46.67 
 
 
331 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 
123 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 
123 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 
123 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 
123 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  36.99 
 
 
139 aa  51.6  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  38.03 
 
 
139 aa  50.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  33.7 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  37.33 
 
 
121 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  37.33 
 
 
121 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  37.33 
 
 
121 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  37.33 
 
 
121 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  37.33 
 
 
121 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  37.33 
 
 
121 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 
136 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  37.14 
 
 
114 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  37.33 
 
 
128 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  37.33 
 
 
128 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  29.31 
 
 
125 aa  47.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  32.61 
 
 
141 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  40.32 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  30.77 
 
 
224 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  34.67 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  34.15 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  35.29 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  40.32 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>