66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1729 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  66.87 
 
 		 159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  62.03 
 
 		 154 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  56.17 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  56.17 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  55.56 
 
 		 174 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  55.41 
 
 		 155 aa  157  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  46.58 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  49.69 
 
 		 152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  50.94 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  39.49 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  41.25 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  39.39 
 
 		 170 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  38.73 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  54.1 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  35.42 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  49.12 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  38.24 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  31.85 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  34.07 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  53.33 
 
 		 113 aa  52.4  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  44.12 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  44.12 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  40.98 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  33.9 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  34.04 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  34.04 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  51.16 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 		 123 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 		 123 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  37.33 
 
 		 133 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 		 123 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 		 123 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  35.71 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  35.71 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  35.71 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  35.71 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  53.85 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  32.32 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  51.16 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  51.16 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  51.16 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  51.16 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  51.16 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  51.16 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  51.16 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  51.16 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  51.16 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  38.1 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  43.14 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  47.62 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  43.14 
 
 		 131 aa  44.3  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  36.05 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  43.59 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  43.59 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  43.59 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  35 
 
 		 331 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  37.78 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  37.5 
 
 		 88 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>