58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7615 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
159 aa  321  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  65.19 
 
 
164 aa  190  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  55.97 
 
 
154 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  52.23 
 
 
160 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  52.23 
 
 
160 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  52.23 
 
 
155 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  52.23 
 
 
174 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  50 
 
 
152 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  45.28 
 
 
167 aa  120  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  45.68 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  40.13 
 
 
159 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  38.22 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  33.55 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  33.12 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  45.61 
 
 
167 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  28.67 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  28.67 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
130 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  37.8 
 
 
134 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  37.8 
 
 
134 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  37.8 
 
 
134 aa  51.2  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  41.79 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  41.79 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  37.7 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  53.33 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  36.07 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  36.36 
 
 
115 aa  47.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  42.22 
 
 
110 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  42.31 
 
 
131 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  35.62 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 
112 aa  44.3  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 
112 aa  44.3  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 
112 aa  44.3  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 
112 aa  44.3  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  41.46 
 
 
79 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  43.59 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  43.59 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  43.59 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  31.33 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  35.94 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  35.94 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  35.94 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  35.94 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  33.7 
 
 
128 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  40.82 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  34.41 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  34.41 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  34.41 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  34.41 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  34.41 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  34.41 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  34.41 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  34.41 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  34.41 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  34.41 
 
 
129 aa  40.8  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>