82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3090 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  45.89 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  41.22 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  44.9 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  31.93 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  51.25 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  41.11 
 
 		 170 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  32.48 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  35.86 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  34.97 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  36.29 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  35.25 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  32.17 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  37.69 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  32.37 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  32.37 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  32.37 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  32.37 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  28.67 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  44.19 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  44.19 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  31.53 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  40.54 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  46.58 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  41.1 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  45.95 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  40.79 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  39.73 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  39.73 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  40.45 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  38.89 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  40.45 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  32.76 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  40.79 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  40.79 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  40.79 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  40.79 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  39.44 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5995  hypothetical protein  42.11 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  40.26 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  39.73 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  40 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  40 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  40 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  37.93 
 
 		 129 aa  47.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  36.11 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  37.93 
 
 		 129 aa  47.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  37.93 
 
 		 129 aa  47.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  37.93 
 
 		 129 aa  47.8  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  37.93 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  36.67 
 
 		 331 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0518  hypothetical protein  56.76 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  30.61 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  30.61 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  30.61 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  30.61 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1487  hypothetical protein  34.72 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3324  hypothetical protein  34.72 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  43.9 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  43.9 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  34.92 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  40.43 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  37.66 
 
 		 115 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  35.44 
 
 		 131 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  32.76 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>