86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1168 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 123 aa  249  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 123 aa  249  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 123 aa  249  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 123 aa  249  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  76.8 
 
 		 125 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1487  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3324  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  51.18 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  51.18 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  44.74 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  44.74 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  44.74 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  44.74 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  42.34 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  37.4 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  43.86 
 
 		 331 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  40.98 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  40.98 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  41.32 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  45.61 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  38.94 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  33.59 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  38.74 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  35.65 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  29.57 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  29.57 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  29.57 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  29.57 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  41.9 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  30.09 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  29.82 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  29.82 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  44.29 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  31.82 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  43.18 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  30.43 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  38.6 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  34.09 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  34.25 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  48.78 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  37.68 
 
 		 170 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  42.25 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  38.96 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  48.89 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  55 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5541  hypothetical protein  55 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.60846 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  33.02 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  33.02 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  40.32 
 
 		 224 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  33.02 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  32.29 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  32.95 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  32.08 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  32.53 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  39.39 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  48.78 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  48.78 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  35.94 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  26.8 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  40.38 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  41.82 
 
 		 131 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  40.38 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5463  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 128 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  40.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  40.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  40.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  40.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  40.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  40.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  40.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  40.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  40.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  40.82 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  47.22 
 
 		 254 aa  40  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  28.85 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  37.74 
 
 		 133 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  36.54 
 
 		 133 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>