86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5541 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5541  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.60846 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  60.42 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  60.42 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  60.42 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  60.42 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  51.52 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  48.61 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  60.42 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  60.42 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  60.42 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  59.52 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  57.14 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  52.17 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  42.62 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  40.79 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  55 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  55 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  55 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  55 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  52.5 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  41.54 
 
 		 113 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  52.27 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  38.16 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  38.16 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  39.58 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  39.58 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  36.67 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  34.38 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  41.79 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  41.79 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  41.18 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  47.62 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  43.18 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  37.29 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  37.29 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  52.5 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  40.98 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  45 
 
 		 331 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  47.62 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  37.29 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  37.29 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  45 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  45 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  50 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  50 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  45 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 152 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  42.86 
 
 		 125 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  45.24 
 
 		 136 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  37.5 
 
 		 133 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  37.5 
 
 		 129 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  44.19 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  47.5 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3167  hypothetical protein  46.15 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  42.5 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  42.5 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  42.5 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  42.5 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  42.5 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  40.91 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  46.34 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>