149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6338 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 155 aa  313  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  68.15 
 
 		 170 aa  208  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  43.59 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  42.95 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  42.95 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  42.95 
 
 		 155 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  42.95 
 
 		 174 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  39.87 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  40.67 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  41.73 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  38.73 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  37.5 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  35.86 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  35.86 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  44.59 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  47.3 
 
 		 133 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  47.3 
 
 		 133 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  47.3 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  44.74 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  40.43 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  31.94 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  33 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  39.51 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  41.03 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  48.33 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  31.52 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  31.52 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  40.91 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  30.85 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  36.96 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  30.85 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  30.85 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  30.85 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  30.85 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  35.94 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  39.73 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  39.73 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  39.73 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  39.73 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  31.52 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  55.81 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  30.95 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  30.95 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  35.44 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  37.23 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  38.03 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  29.47 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  33.6 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  36.11 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  36.11 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  35.53 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  35.06 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  43.64 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  34.62 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  35.79 
 
 		 331 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  33.6 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  39.06 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  38.46 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  47.17 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  47.17 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  47.17 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  47.17 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  47.17 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  47.17 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  47.17 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  47.17 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  47.17 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  47.17 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  33.33 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  73.08 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  36.54 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  37.5 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  37.5 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  28.93 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  41.27 
 
 		 131 aa  44.3  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5995  hypothetical protein  46.67 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>