154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5537 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  100 
 
 
131 aa  258  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  44.92 
 
 
128 aa  90.1  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2813  transposase  37.93 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  36.28 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  43.68 
 
 
159 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1178  putative DNA-binding protein  38.79 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  65.12 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  37.62 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  44.29 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  35.65 
 
 
131 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  38.04 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  64.29 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  38.32 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  39.02 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  33.87 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  40.3 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  32.98 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  40.58 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  37.63 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  38.6 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  38.6 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  38.6 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  38.6 
 
 
123 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  28.71 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  28.71 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  51.92 
 
 
159 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  39.39 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  40.32 
 
 
133 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  27.72 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  29.55 
 
 
225 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  38.36 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  38.36 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  38.36 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  29.55 
 
 
225 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  38.36 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  37.74 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  36.36 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  38.36 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  29.55 
 
 
225 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  33.87 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  29.55 
 
 
225 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  29.55 
 
 
225 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  29.55 
 
 
225 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  31.03 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  40.32 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  40.32 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  40.32 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  40.32 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  40.32 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  40.32 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  40.32 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  40.32 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  40.32 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  40.32 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  39.74 
 
 
139 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  54.76 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  54.76 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  54.76 
 
 
150 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  35.45 
 
 
156 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  33.9 
 
 
160 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  35.45 
 
 
156 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  40.26 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5562  transposase IS3/IS911 family protein  32.48 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  38.3 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  38.3 
 
 
174 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  38.3 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  38.3 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  35.23 
 
 
141 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  45.61 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  33.93 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0034  transposase  30.19 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  30 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5541  hypothetical protein  52.27 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.60846 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  50 
 
 
146 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  32.52 
 
 
113 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  36.59 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  29.59 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  29.59 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  50 
 
 
331 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  38.71 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  31.36 
 
 
152 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  31.36 
 
 
152 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  31.36 
 
 
152 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>