129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2255 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
113 aa  229  9e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6937  transposase IS3/IS911 family protein  38.33 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2521  transposase IS3/IS911 family protein  40.19 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1020  transposase IS3/IS911 family protein  40.19 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1192  transposase IS3/IS911 family protein  40.19 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1403  transposase IS3/IS911 family protein  40.19 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  35.58 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  35.58 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  38.46 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  38.46 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  38.46 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6372  transposase ISRme19  35.34 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1168  transposase IS3/IS911 family protein  35.65 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.375824  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2667  transposase IS3/IS911 family protein  35.65 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  35.96 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2977  transposase IS3/IS911 family protein  35.65 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0835  transposase IS3/IS911 family protein  35.65 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.333335 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4023  transposase IS3/IS911 family protein  36.28 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  37.39 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  37.5 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  38.46 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2709  transposase IS3/IS911  33.05 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  36.54 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1173  transposase IS3/IS911  33.65 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3061  transposase IS3/IS911  33.65 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  40.21 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2417a  hypothetical protein  34.82 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2099  normal  0.256118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1867  hypothetical protein  34.82 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859913  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  43.94 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  44.93 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  44.29 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5984  transposase IS3/IS911 family protein  39.42 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4330  hypothetical protein  44.26 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  40.79 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  43.24 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  39.51 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4707  transposase IS3/IS911 family protein  35.14 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15139  normal  0.0855064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2471  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  35 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  40.79 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  46.58 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  46.58 
 
 
147 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  33.02 
 
 
331 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  37.11 
 
 
131 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  53.33 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3324  hypothetical protein  32.29 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1487  hypothetical protein  32.29 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0712  transposase IS3/IS911 family protein  37 
 
 
114 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0424  transposase IS3/IS911 family protein  27.52 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  35.79 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  35.79 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  36.14 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  36.14 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  36.14 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  51.16 
 
 
174 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  35.79 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  51.16 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  51.16 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  51.16 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  34.94 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  34.72 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  53.33 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  67.65 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  42.86 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  32.41 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3167  hypothetical protein  38.67 
 
 
76 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  33.33 
 
 
141 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  47.92 
 
 
154 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  57.14 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  40.28 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  39.73 
 
 
225 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  39.73 
 
 
225 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>