50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6181 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6181  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6377  helix-turn-helix, Fis-type  59.21 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6339  transposase IS3/IS911  52.8 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0080  putative ISPpu14, transposase Orf1  47.2 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195214 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7466  transposase IS3/IS911 family protein  48.75 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2548  putative transposase, ISPpu14 Orf1 like  47.2 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3738  putative transposase  47.2 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0063  putative transposase  47.5 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7615  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.557321  normal  0.767348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1729  transposase  48.12 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6838  transposase IS3/IS911 family protein  44.37 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6579  transposase IS3/IS911 family protein  43.54 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  0.0213341 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6338  transposase IS3/IS911 family protein  40.67 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3806  transposase IS3/IS911  38.41 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179711  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3090  transposase IS3/IS911 family protein  37.69 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.234179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1410  transposase IS3/IS911 family protein  37.69 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2291  transposase IS3/IS911 family protein  37.11 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0340  transposase IS3/IS911  55.77 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394046  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4917  transposase IS3/IS911 family protein  56.6 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2523  transposase IS3/IS911 family protein  37.29 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  40.26 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0039  transposase IS3/IS911 family protein  42.42 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.251766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4437  ISPpu14, transposase Orf1  42.42 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3979  ISPpu14, transposase Orf1  42.42 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.061856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3499  ISPpu14, transposase Orf1  42.42 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4532  transposase IS3/IS911 family protein  42.37 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  42.42 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4441  ISPpu14, transposase Orf1  40.91 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5398  ISPpu14, transposase Orf1  40.91 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180898  hitchhiker  0.00224199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2255  transposase IS3/IS911 family protein  67.65 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59560  putative transposase  41.51 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000451913  hitchhiker  4.3260500000000003e-19 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  48 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  44.64 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5581  hypothetical protein  47.37 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5175  transposase IS3/IS911 family protein  35.38 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0524  hypothetical protein  45.1 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.104385  hitchhiker  0.00639859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0570  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0784738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2457  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.528659  normal  0.919358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2918  transposase IS3/IS911 family protein  40.48 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0518  hypothetical protein  47.62 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>