More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0875 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 101 aa  209  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  70.41 
 
 		 98 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0473  ISxac3 transposase  60 
 
 		 293 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  54.95 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  54.95 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  54.95 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  49.46 
 
 		 97 aa  87.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  45.16 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2906  transposase IS3/IS911 family protein  44.71 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  36.26 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  36.26 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  36.26 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  36.26 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  36.26 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  43.68 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1290  ISCps2, transposase orfA  40 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  35.16 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2410  ISCps2, transposase orfA  40 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0595959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  41.67 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1182  transposase IS3/IS911 family protein  36.14 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  39.78 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  42.71 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  42.71 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  42.71 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  42.71 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  42.71 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  42.71 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  42.71 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  42.71 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  42.71 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  42.71 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  43.16 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  43.16 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  43.75 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  43.16 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  43.16 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  43.16 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  43.75 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  43.16 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  43.16 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  38.04 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  37.89 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  37.89 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  37.89 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  37.89 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  32.97 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  32.97 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  32.97 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  40.86 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  40.86 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  44.44 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  44.44 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  44.44 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  44.44 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  44.44 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  44.44 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  44.44 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1916  transposase IS3/IS911 family protein  37.62 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  38.04 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  42.11 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  35.48 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  35.48 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  38.3 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  34.34 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  34.34 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  34.02 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  34.02 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  37.36 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  34.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  34.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  34.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  34.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  34.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  34.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  34.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  34.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  34.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  34.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  34.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  34.02 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  40.86 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>