298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1290 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1290  ISCps2, transposase orfA  100 
 
 
98 aa  199  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2410  ISCps2, transposase orfA  97.96 
 
 
98 aa  195  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0595959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0546  transposase IS3/IS911  41.3 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.266021  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1296  transposase IS3/IS911  41.3 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1431  transposase IS3/IS911  41.3 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0875  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00280  transposase IS3/IS911 family protein  41.49 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13730  transposase IS3/IS911 family protein  41.49 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6035  transposase IS3/  36.46 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  39.13 
 
 
97 aa  59.3  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  39.13 
 
 
97 aa  59.3  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  39.36 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  39.13 
 
 
383 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  36.73 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  35.87 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  35.87 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  35.87 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  35.87 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  35.87 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  36.96 
 
 
92 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  40 
 
 
101 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1828  transposase IS3/IS911 family protein  32.97 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2200  transposase IS3/IS911 family protein  32.97 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  37.5 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  37.5 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  37.5 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2010  transposase IS3/IS911 family protein  32.97 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.639133  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  37.5 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0731  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0479858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2950  transposase IS3/IS911 family protein  32.97 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2694  transposase IS3/IS911 family protein  32.97 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1485  transposase IS3/IS911 family protein  32.97 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  32.29 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  36.67 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  36.67 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  38.46 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01552  transposase, IS911  35.79 
 
 
97 aa  54.7  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617213  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  34.78 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02080  transposase, IS911  35.79 
 
 
97 aa  54.7  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03752  transposase, IS911  35.79 
 
 
97 aa  54.7  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1560  transposase IS3/IS911 family protein  31.87 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  36.47 
 
 
91 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  35.16 
 
 
92 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1824  transposase IS3/IS911 family protein  31.87 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  36.47 
 
 
91 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  36.47 
 
 
91 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  39.13 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  35.16 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  35.16 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  35.16 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  35.16 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  35.16 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  35.16 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  35.16 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  35.16 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  35.16 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  35.16 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  35.16 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 
90 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 
97 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 
97 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  32.22 
 
 
92 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  38.2 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0401  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  36.78 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1398  transposase-like  34.83 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.276724  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1745  transposase-like  34.83 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  29.47 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  36.63 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  36.63 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  27.55 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  27.55 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  29.21 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  32.65 
 
 
98 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  29.21 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  38 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>