More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2029 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 92 aa  187  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  69.57 
 
 		 92 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  60.67 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  60.67 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  59.78 
 
 		 92 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 		 91 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  61.8 
 
 		 90 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 		 92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  58.24 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  59.55 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  59.55 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  59.55 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  58.24 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  61.36 
 
 		 92 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  59.78 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  59.78 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  58.43 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  58.43 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  59.78 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  53.85 
 
 		 97 aa  103  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  53.85 
 
 		 97 aa  103  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  56.63 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  56.63 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  67.5 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  50.55 
 
 		 383 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  56.67 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 94 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  55.26 
 
 		 81 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  62.34 
 
 		 78 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  55.56 
 
 		 73 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  55.56 
 
 		 73 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 		 94 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2986  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1555  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4232  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1331  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  43.16 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  37.89 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0494  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0656  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0685  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0891  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0982  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1025  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1464  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1514  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1905  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2025  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2032  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2057  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2131  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2134  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2168  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2172  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2314  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2368  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4293  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4301  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4441  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4581  ISSod1, transposase OrfA  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3020  transposase IS3/IS911  44.32 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4654  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4595  transposase IS3/IS911 family protein  44.32 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267513  normal  0.816479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>