More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5424 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 92 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 92 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 92 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 92 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  93.75 
 
 		 84 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  66.3 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  70.93 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  68.48 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  68.48 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  69.66 
 
 		 90 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  68.48 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  68.54 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  68.54 
 
 		 90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  66.3 
 
 		 92 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  66.3 
 
 		 92 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  66.3 
 
 		 92 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  66.3 
 
 		 92 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  66.3 
 
 		 92 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  66.3 
 
 		 92 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  93.51 
 
 		 78 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  68.18 
 
 		 92 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  67.78 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  66.29 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  66.29 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  66.29 
 
 		 90 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  61.54 
 
 		 97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  61.54 
 
 		 97 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  62.92 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 		 383 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  62.92 
 
 		 92 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  60.67 
 
 		 90 aa  114  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  60.67 
 
 		 90 aa  114  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  57.61 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  60.71 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  58.82 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  58.82 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  62.96 
 
 		 81 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  58.89 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  55.79 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  51.06 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  58.33 
 
 		 73 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  58.33 
 
 		 73 aa  92.8  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  48.94 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  46.88 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  52.5 
 
 		 78 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2232  transposase IS3/IS911 family protein  55.07 
 
 		 72 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13985  normal  0.028458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  40.22 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  40.22 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  40.22 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  40.22 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  40.22 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  40.22 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  47.19 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  47.19 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  47.19 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  47.19 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  47.19 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  47.19 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  47.19 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  45.36 
 
 		 97 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  46.24 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2819  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00530673  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0494  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0656  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0685  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0891  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1464  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1905  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2025  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2032  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2057  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2131  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2134  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2168  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2172  ISSod1, transposase OrfA  42.22 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4232  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2986  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3112  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2306  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.332682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3585  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.750482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>