More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2340 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
92 aa  188  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  96.74 
 
 
92 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  96.74 
 
 
92 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  96.74 
 
 
92 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  96.74 
 
 
92 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  96.74 
 
 
92 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  96.74 
 
 
92 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  96.74 
 
 
92 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  96.74 
 
 
92 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  96.74 
 
 
92 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  96.74 
 
 
92 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  96.74 
 
 
92 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  95.65 
 
 
92 aa  179  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  96.43 
 
 
118 aa  167  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  94.12 
 
 
118 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  94.12 
 
 
118 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  94.12 
 
 
112 aa  165  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  76.14 
 
 
92 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  70.79 
 
 
90 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 
97 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 
97 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  68.54 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  69.66 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  69.66 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  62.92 
 
 
90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  67.03 
 
 
92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  62.92 
 
 
90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  62.5 
 
 
93 aa  114  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  62.92 
 
 
92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  62.92 
 
 
92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  62.92 
 
 
92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  59.34 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  62.92 
 
 
92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  61.29 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 
92 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  71.05 
 
 
81 aa  110  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  55.68 
 
 
97 aa  103  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  55.68 
 
 
97 aa  103  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  56.67 
 
 
95 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  53.41 
 
 
383 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  52.81 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  52.81 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  52.81 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  56.94 
 
 
73 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  47.87 
 
 
94 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  56.94 
 
 
73 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 
90 aa  89.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 
94 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 
94 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 
94 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4083  ISxac3 transposase  90.91 
 
 
57 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151161  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4146  ISxac3 transposase  90.91 
 
 
57 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 
78 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  58.44 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  51.25 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  43.62 
 
 
94 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0739  putative transposase  92.68 
 
 
43 aa  80.9  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.646917  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2232  transposase IS3/IS911 family protein  64.91 
 
 
72 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13985  normal  0.028458 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  47.19 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  47.19 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  47.19 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  47.19 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  47.19 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  47.19 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  47.19 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2751  transposase  41.94 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.268757  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 
99 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5538  transposase IS3/IS911 family protein  41.94 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.414602  normal  0.0181307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 
97 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  44.44 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  44.44 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  41.86 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  34.44 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  44.32 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  44.32 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  42.68 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  41.05 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  41.05 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  41.05 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  46.15 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  34.44 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  34.44 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  34.44 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  34.44 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  34.44 
 
 
97 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  39.77 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>