More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1469 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
99 aa  199  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  73.47 
 
 
98 aa  154  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  73.47 
 
 
98 aa  154  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  73.47 
 
 
98 aa  154  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  71.43 
 
 
98 aa  149  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  71.43 
 
 
98 aa  149  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0644  IS3/IS911 family transposase OrfA  73.68 
 
 
99 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255096  normal  0.377263 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0630  transposase IS3/IS911  68.37 
 
 
98 aa  143  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1314  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 
98 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1357  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 
98 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1027  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 
98 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0730  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 
98 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0706575  decreased coverage  0.000000321811 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1052  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 
98 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1477  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 
98 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.21104  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1355  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 
98 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1119  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 
98 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1025  transposase IS3/IS911 family protein  63.92 
 
 
98 aa  130  6e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.103265 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0539  IS3/IS911 family transposase OrfA  71.25 
 
 
91 aa  123  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0925  IS3/IS911 family transposase OrfA  81.97 
 
 
61 aa  102  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  48.94 
 
 
92 aa  80.1  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  49.49 
 
 
97 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  47.96 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  47.96 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  48.91 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  47.96 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  46.39 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  46.39 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  44.79 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  44.79 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  45.05 
 
 
92 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  45.05 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  43.48 
 
 
90 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  42.39 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  42.39 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  43.96 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  43.96 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  43.96 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  43.96 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  43.96 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  43.96 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  43.96 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  43.96 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  43.96 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  43.96 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0083  transposase family  44.33 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000612813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  42.39 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  43.96 
 
 
92 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  46.15 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  46.15 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  46.15 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  46.15 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  46.15 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  46.15 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  46.15 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0137  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  44.79 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1661  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  41.94 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  41.94 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  41.94 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  41.94 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  41.94 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1714  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  44.79 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0903  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  41.94 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  41.94 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0860  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0264  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2978  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0163394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4402  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2183  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0276748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2113  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1590  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3957  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2077  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1279  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1009  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0998  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00128596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0898  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4368  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2190  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123269  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  46 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2941  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  46 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0243  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.392452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2141  transposase family  44.79 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.904043  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  42.27 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  40.62 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1598  ISSd1, transposase orfA/B, fusion  43.75 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0063683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0559  transposase family  43.75 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0370351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  43 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  43 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  43 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  43 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  43 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  43 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  43 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4644  transposase family  44.79 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>