73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0925 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0925  IS3/IS911 family transposase OrfA  100 
 
 
61 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014033 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0644  IS3/IS911 family transposase OrfA  93.1 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255096  normal  0.377263 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0630  transposase IS3/IS911  83.61 
 
 
98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.318387 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  81.97 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  81.97 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  81.97 
 
 
99 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1496  transposase IS3/IS911 family protein  77.05 
 
 
98 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  0.814914 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1166  transposase IS3/IS911 family protein  77.05 
 
 
98 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1229  transposase IS3/IS911 family protein  77.05 
 
 
98 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0730  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0706575  decreased coverage  0.000000321811 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1025  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.103265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1027  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0659749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1052  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1119  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1355  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019413 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1357  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1477  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.21104  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1314  transposase IS3/IS911 family protein  65 
 
 
98 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0539  IS3/IS911 family transposase OrfA  74.42 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  51.61 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  51.61 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  48.39 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  48.39 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  48.39 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  48.39 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  48.39 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  48.39 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  48.39 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  48.39 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  48.39 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  48.39 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  48.39 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  46.77 
 
 
99 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  46.77 
 
 
99 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  49.18 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0635  putative transposase  49.18 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0996397  normal  0.0589487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  49.18 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  49.18 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  49.18 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  49.18 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  49.18 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2847  transposase IS3/IS911  45.45 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.761522  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  70 
 
 
90 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  72.41 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1992  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.203185  normal  0.714899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0651  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0462736  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1128  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1988  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.275987  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3325  IS600 ORF1  46.77 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2643  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0189783  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  40.32 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  45.16 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2525  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
80 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2397  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.782698  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0513  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0520  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0692  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0703  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0705  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640012  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0709  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2401  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0789235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3188  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3354  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.548623  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4117  transposase IS3/IS911 family protein  37.68 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  46.67 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  43.33 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 
98 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2764  transposase IS3/IS911 family protein  45 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0267308  normal  0.0284347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>