More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4074 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 90 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  62.64 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  56.52 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  56.04 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  57.3 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  57.3 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  58.24 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  57.3 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  59.3 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  56.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  56.18 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  55.06 
 
 		 97 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  55.06 
 
 		 97 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  55.06 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  56.52 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  56.52 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  56.52 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  52.75 
 
 		 92 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  52.75 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  52.75 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  52.75 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  52.75 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  52.75 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  52.75 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  52.75 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  52.75 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  52.75 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  52.75 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  52.75 
 
 		 92 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  53.26 
 
 		 94 aa  89.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  51.69 
 
 		 92 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  51.65 
 
 		 92 aa  89.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  52.17 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  52.17 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  52.17 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  59.72 
 
 		 73 aa  87  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  59.72 
 
 		 73 aa  87  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  51.11 
 
 		 95 aa  84.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  55.7 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  50.54 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  51.81 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  50.59 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  50.59 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 		 383 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  47.83 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  47.83 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  50.6 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  48.68 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  44.68 
 
 		 100 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  42.55 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  42.22 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1073  IS3 family transposase orfA  38.46 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.604189  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1115  IS3 family transposase orfA  38.46 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1014  IS3 family transposase orfA  38.46 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  42.71 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1011  IS3 family transposase orfA  38.46 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  45.45 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1610  transposase IS3/IS911  42.39 
 
 		 101 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  44.57 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  35.16 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  35.16 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  35.16 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  35.16 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  35.16 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  35.16 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0016  IS3/IS911 family transposase OrfA  42.86 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1688  IS3/IS911 family transposase OrfA  42.86 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0616335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0644  IS3/IS911 family transposase OrfA  42.22 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255096  normal  0.377263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2284  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2395  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2271  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2848  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.389181 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  44.44 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  42.86 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  42.86 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2854  transposase IS3/IS911 family protein  37.61 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0577  transposase IS3/IS911 family protein  37.61 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2584  transposase IS3/IS911 family protein  37.61 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  42.05 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>